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Comprendre l'effet des caractéristiques des espaces naturels sur la survie et la distribution spatiale des espèces est un enjeu majeur dans le contexte de la fragmentation de l'habitat. Cela nécessite de s’intéresser à de larges échelles spatiales et d'intégrer les caractéristiques de colonisation des espèces qui définissent comment les contraintes à l'occupation de l'espace sont perçues par les espèces. L'objectif de ce travail est de proposer une modélisation multi-échelle de l'habitat et de la colonisation permettant de mieux appréhender la complexité des effets de l'hétérogénéité spatiale de l'habitat sur la survie et la distribution spatiale des métapopulations. Nous définissons l'« île » d'habitat comme une échelle intermédiaire de structuration de l'habitat entre celle d'une population et celle de toute la métapopulation. L'île d'habitat correspond à un ensemble d'unités d'habitat contigus, chaque unité pouvant contenir une population. Dans ce travail, l'habitat est décrit soit de manière spatialement implicite par la distribution de tailles des îles d'habitat, soit de manière spatialement explicite par la théorie de la percolation selon un gradient de situations (percolantes ou non percolantes) dans lequel on fait varier la densité d'habitat, l'agrégation spatiale des unités d'habitat, la distribution de tailles des îles d'habitat et la géométrie des îles. D'autre part, la colonisation est décomposée en une composante locale, à l'échelle d'une île, et en une composante régionale. Ce travail fait ressortir que l'effet des caractéristiques de l'habitat dépend fortement des caractéristiques de la colonisation des espèces. Quand la colonisation est limitée à l'échelle d'une île d'habitat, la distribution de tailles des îles détermine le régime dynamique des métapopulations : l'atteinte d'un équilibre (nul ou non nul) ou au contraire une lente décroissance de l'occupation vers l'extinction. De plus, quand la colonisation est contrainte aux plus proches voisins, nous mettons en évidence un lien direct entre l'agrégation locale de l'habitat et le seuil d'extinction ainsi que l'occupation des métapopulations. Nous avons aussi étudié des stratégies de colonisation mixtes et soulevons des différences d'occupation en fonction du ratio entre colonisation locale et colonisation régionale et en fonction de l'habitat. Ces résultats permettent un nouvel éclairage sur les contraintes spatiales de la dynamique des métapopulations.

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